Usługi rozliczeniowe realizowane są przez KIR za pośrednictwem następujących elektronicznych systemów rozliczeniowych:

• Elixir – to system rozliczeń międzybankowych w złotych, który dostępny jest od 1994 roku. Pozwala na sprawną i bezpieczną realizację przelewów i poleceń zapłaty. Codziennie w systemie Elixir odbywają się trzy sesje rozliczeniowe, dzięki którym klienci mogą przekazywać środki pomiędzy rachunkami prowadzonymi w różnych bankach w ciągu zaledwie kilku godzin. Więcej informacji znajduje się na https://www.banki.kir.pl/elixir/system-elixir/.
• Euro Elixir – to system rozliczeń międzybankowych w euro, pozwalający na rozliczanie płatności w relacjach krajowych i transgranicznych. System Euro Elixir spełnia standardy unijne, a dodatkowo funkcjonuje w ramach zintegrowanej infrastruktury Jednolitego Obszaru Płatności w Euro (SEPA). System umożliwia realizację płatności w euro w dniu, w którym została ona zlecona, niezależnie od tego, czy jest to płatność krajowa czy transgraniczna. Więcej informacji o systemie znajduje się na https://www.banki.kir.pl/euro-elixir/system-euroelixir/. 
• Express Elixir - to pierwszy w Polsce, a drugi w Europie system rozliczeń płatności natychmiastowych, umożliwiający realizację przelewów międzybankowych w czasie liczonym w sekundach. Więcej informacji znajduje się na https://www.banki.kir.pl/express-elixir/. 

KIR udostępnia system Ognivo, który umożliwia bezpieczną i szybką komunikację on-line pomiędzy bankami a innymi podmiotami uprawnionymi do uzyskiwania informacji objętych tajemnicą bankową. Z usługi korzystają banki, ZUS, Poczta Polska, urzędy skarbowe, izby celne, urzędy miast oraz komornicy sądowi. 

W ofercie KIR znajdują się także rozwiązania mające na celu wspieranie rozwoju rynku płatności bezgotówkowych, w tym podpis elektroniczny Szafir oraz Paybynet – system gwarantowanych, bezpośrednich i szybkich płatności internetowych. Jako SWIFT Service Bureau, KIR oferuje dostęp do globalnej sieci SWIFTNet, pozwalającej na realizację międzynarodowych operacji finansowych. Najnowszym produktem wdrażanym przez KIR jest lokalny system rozliczeń płatności kartowych Inkart.